扁平疣的有效治疗方法包括：药物治疗、物理治疗及手术治疗。
1、药物治疗：患者可遵医嘱选择维a酸软膏，咪奎莫特软膏等外用药物进行涂抹治疗。如果患者的病情过于严重的可以选择口服异维a酸胶囊。
2、物理治疗：冷冻、电灼、刮除等都是有效的治疗方法，皮损数目多者可以分批分次治疗。
3、手术治疗：用手术的方法，对于扁平疣有很好的治疗效果。注意在手术治疗的时候一定要彻底切除干净扁平疣，如果不切除干净的话，很容易就会复发。建议患者根据自身的病情和身体状态，听从专业医生的意见进行规范的诊治。