目前做胃镜有两种选择即普通胃镜和无痛胃镜，根据医院级别不同，收费标准存在差异。省级医院收费标准为普通胃镜大概260元左右，无痛胃镜800元左右。
胃镜属于侵入性操作，胃镜前需要化验术前四项即乙肝、丙肝、梅毒和艾滋，为了避免交叉感染；还需要做心电图检查，一共大约是1000元左右。
如果检查结束后发现问题如需取活检或进行息肉切除，需要额外收费。一个活检病理标本大概200元左右，切除一个息肉大概是300元左右；
还需要用圈套器或热活检钳。单纯检查大概1000元左右，如果加上活检或治疗，大概在2000-3000元之间。具体费用以患者实际就诊医疗机构收费为准。