两个大脚趾边的骨头突出而且还很痛可能是痛风性关节炎、拇外翻等疾病引起的，具体分析如下：
1、痛风性关节炎：由单钠尿酸盐沉积引起的一种晶体相关性关节病，一般表现为关节肿胀、头痛、全身乏力以及活动受限等，也会出现脚大拇趾旁边骨头突出疼痛的症状。
2、拇外翻：长时间穿过紧的鞋子导致拇外翻，表现为大脚趾畸形、肿胀、发红等，会出现脚大拇趾旁边骨头突出疼痛的症状，比较严重的时候，还会影响患者的运动功能，造成行走障碍。建议患者出现此症状时，应到医院就诊，查明病因，对症治疗。