男性生殖处有小颗粒，常见以下原因导致：
1.珍珠样丘疹。一般是在龟头以及冠状沟的位置，是由于龟头局部的分泌物或者是包皮垢，长期清洁不到位引起的增生现象。
2.尖锐湿疣。多数在外生殖器粘膜，或粘膜交接处生长，但也可在肛门缘周围生长，多由不洁夫妻生活传染所致。
3.生殖器疱疹。常与不洁净的性接触传播有关，多数患者可有疼痛、瘙痒等不适感。 若患者出现上述症状，建议及时就医进行治疗，以免耽误病情。