萎缩性胃炎伴肠化生可以通过以下方法进行治疗。
1、促进胃动力治疗：如多潘立酮、西沙必利、伊托必利等，此类药物通过促进胃排空以及增加胃近端的张力，而提高胃肠的运动功能；
2、清除幽门螺杆菌治疗：幽门螺杆菌感染在慢性胃炎中有至关重要的作用，会导致病情进展。当查幽门螺杆菌阳性时，要给予幽门螺杆菌三联和四联的根除疗法。
3、抑酸治疗：慢性萎缩性胃炎的胃酸偏低。口服抑酸药后腹痛、腹胀等症状能够明显减轻，所以适当给予抑酸药可以有助于病情的恢复。 以上药物需在医生指导下进行使用，不可自行使用，以免产生不良反应，症状严重的患者，及时就医，以免延误治疗。