芦荟胶囊属于刺激类泻药，长期使用的副作用与危害主要是会产生依赖性，还会出现结肠黑变病。并且由于芦荟胶囊当中的嘌呤含量比较高，痛风患者服用后可能会加重病情。
另外，哺乳期妇女及肝肾功能不全者慎用，孕妇禁用。由于用药具有专业性，芦荟胶囊的服用需在医生的指导下进行，不可私自乱用药物，以免出现不良反应。