全飞秒的弊端如下。
1、二次手术难度高：由于全飞秒手术已将一块角膜基质取出，因此二次手术的难度大大上升。
2、复发风险：术后若不正确用眼，仍会导致视力下降，全飞秒手术只能解决现存的视力下降问题。
3、并发症：并发症主要针对术者技术以及患者眼部具体情况而言，可能会出现近视欠矫或过矫等风险。 建议患者全飞秒后产生不适的患者，及时就医，以免延误治疗。