药流就是用药物来终止怀孕，而人流则是通过人工手术进行的，这就是两者在操作方法上根本的区别。除此之外，还有其他区别，具体如下：
1、时间区别
药流时间，在医学上严格控制在停经49天以内。而人流时间，在怀孕14周以内都是可以做的。如果超出了14周，就要进行引产了。顺便提一下，最佳的时间是停经后35-50天之间，因为这时子宫不太大，妊娠组织不太多，胎儿也小，容易吸净，手术时间短，出血少。
2、感染原因不同
药流的感染，通常是不注意外阴卫生，或者是药流之后，还没完全恢复又进行性生活了，这就诱发生殖器炎症，引发阴道流血、腹痛、阴道分泌物有臭味等。而人工流产的感染则是表现在，子宫内膜及子宫肌层受损，再次妊娠时易发生习惯性流产和早产。
3、恢复时间不同
药物流产的时间比较长，而且服药之后，会长时间的阴道出血。人工流产相对恢复的时间短一些，只要足够注意。