水合氯醛对宝宝副作用是，长期服用可造成依赖感及耐受力，忽然断药可造成神经质、出现幻觉、心烦、出现异常激动，瞻妄、震颠等比较严重撤药综合征。
偶有产生过敏性皮疹，荨麻疹。对肝、肾有危害功效。大使用量能抑止心脏收拢力，减少心脏不应期，并抑止延髓的吸气及血管健身运动神经中枢。
对胃粘膜有刺激性，易造成恶心想吐、呕吐。