男性生殖器肿的原因如下：
1、包皮过长或包茎：不少男性朋友存在包皮过长或者包茎的现象，这是引起包皮水肿的最主要因素之一。
2、不注意外生殖器卫生：自身不良习惯，没有过多时间注意外生殖器的卫生，因而很容易受到细菌的侵袭。
3、手淫损伤所致：由于手淫动作过于粗暴，从而就会导致不同程度的包皮破损。