通常百令胶囊都是饭后的半个小时之后吃，这样才能彻底发挥出药效。百令胶囊可以治疗肝病科：肝炎后肝硬化、脂肪肝、血吸虫病、肝癌导致的肝脏肿大、酒精肝。
肾内科：肾小球肾炎、系统性红白狼疮性肾炎、过敏性紫癜肾炎、IGA肾病（A免疫球蛋白肾病）、糖尿病肾病、高血压肾损害、急性肾功能衰竭、肾病综合征等。
内分泌科：肾移植所导致的肾功能损坏、排斥反应及白细胞减少、糖尿病肾病、甲状腺功能亢进、桥本氏甲状腺炎。中医科及老干保健科：慢性阻塞性肺病、慢性肾炎、肝炎后肝硬化、高血压、高血脂、心脑血管病、免疫力低下。
呼吸科：支气管哮喘、慢性支气管炎、肺结核、肺气肿、硅肺。男性科：男性性功能障碍。