打喷嚏时有异味主要考虑是由于口臭引起的，由于患者口腔、鼻腔或胃部出现了问题。也有可能是由于使用了药物，吃了大蒜、洋葱等刺激性食品，引起的生理性口臭。
也可能是病理性口臭，比如患有牙周炎、牙龈、牙龈炎等能够引起口源性口臭。患有咽炎、化脓性扁桃体炎、鼻窦炎、消化不良、胃病都能导致非口腔溃疡性口臭。