肝囊肿的病因有，肝内胆管炎症、胆石症等病变刺激导致，由于病变影响，胆汁排泄不通畅，诱发囊肿病变，建议抗炎利胆护肝等保守治疗为主。
创伤因素：在肝脏外伤以后，导致肝脏内部出血，建议及时去医院检查治疗。先天性发育异常：可能和胚胎时期肝内胆管和淋巴管发育障碍相关，建议行手术切除发育畸形的淋巴管，近远端淋巴管吻合从而恢复淋巴管的通畅性，如出现其他异常情况，应及时就医。