重度萎缩性胃炎伴重度肠化，可以先通过药物进行治疗，药物包括促胃动力药物、保护胃黏膜药物、促胃黏膜愈合的药物等。如果药物治疗不理想，或者病情比较严重，就需要通过手术的方法进行治疗，术后还要在服用药物继续治疗。
患者在接受治疗期间，需要对饮食做出改变，首先要改变进食习惯，要选择少食多餐的方式进食。建议患者根据自身的病情和身体状态，听从专业医生的意见进行规范的诊治。