凌晨3点醒了睡不着的病因是：可能是存在睡眠障碍，可以应用氟西泮、硝西泮、劳拉西泮进行治疗。还可能是神经衰弱所引起的，可以应用谷维素，维生素B1进行治疗。
也可能是抑郁症导致的，可以应用阿米替林、多虑平、氯丙咪嗪进行治疗。建议患者去医院查明病因，对症治疗。应遵医嘱服用药物，对以上药物过敏者禁用。