尿道疼痛可以口服药物头孢克肟、红霉素、氧氟沙星等治疗，对于非淋球菌尿道炎引起的疼痛可以口服药物阿奇霉素、多西环素、加替沙星、左氧氟沙星等治疗，前列腺炎引起的疼痛。
也可以选择喹诺酮类抗生素，如左氧氟沙星、环丙沙星、氧氟沙星等，有头孢类过敏史的患者不宜使用、用药期间不可饮酒，建议在专科医生的指导下使用药物。