男人有败血症会影响怀孕的，在男性败血症发病时，是不建议怀孕的。败血病是由细菌、病毒等感染所导致的，在治疗时会采用敏感的抗生素以及抗感染的药物进行治疗，这些药物会对男性的精子质量造成影响，所以在败血症恢复期间，或者是发病期间都应该要注意不要怀孕，会对后期胎儿生长发育造成异常。
所以建议通过医生治疗后，身体各项指标恢复正常，咨询医生能否备孕。