病毒性脑炎治愈后可能会遗留后遗症。病毒性脑炎是病毒感染到中枢神经系统，累及脑细胞实质引起的炎症性疾病，比较常见的症状表现为幻觉、妄想、易激惹，还容易出现癫痫发作，不同程度的认知功能受损，常表现为记忆力、学习能力下降，有时会出现偏瘫、失语以及视觉异常等。
经过治疗后患者症状有不同程度的改善，神经系统缺失程度有一定程度的恢复，但因为脑实质损伤后不可再生，所以部分神经功能缺损不可逆、不可修复，神经功能损伤可能长期存在，就会遗留后遗症。