肛周脓肿主要需要进行手术治疗，不能手术者也可进行抗炎等保守治疗。肛周脓肿是直肠、肛管的感染性疾病，由于肛周脓肿通常位于肛周表面，疼痛比较剧烈。
对于浅表的小脓肿可以在门诊即可完成脓肿切开引流手术或脓肿穿刺引流术。对于较大或深部的脓肿，患者则需住院完成手术，酌情行脓肿切开引流术，多口引流术，脓肿挂线术等。
也可在医师的指导下使用氧氟沙星等抗生素进行保守治疗。建议患者及时到医院进行治疗，不要自行用药。