脑血栓若想得到较好的治疗效果，一般需要抓紧治疗的时间，尤其是在发病3-4.5小时内，如果能够及时到医院进行阿替普酶或者尿酶溶栓治疗，预后效果会好很多。若失去最佳治疗时机，一般可根据以下病因进行治疗：
1.动脉粥样硬化：一般通过他汀类药物进行治疗，如阿托伐他汀、瑞舒伐他汀等，同时需要服用阿司匹林，或者氯吡格雷等抗血小板聚集的药物。
2.心源性脑血栓：如房颤或者其它症状所引起，一般通过抗凝药物进行治疗，如华法林或者其它新型抗凝药物。