萎缩性胃炎伴肠化生患者首先应去医院进行胃镜检查和病理检查，根据病情来决定治疗方案：
1.如果患者伴有幽门螺旋杆菌的感染，需要先进行根除细菌治疗，可以使用四联药物治疗，如枸橼酸铋钾、阿莫西林、甲硝唑、奥美拉唑等。
2.病情较为严重的患者可以选择使用中成药，如胃复春、摩罗丹等，但需要长期使用。西药可使用叶酸、维生素E，直到胃镜检查时不见萎缩，再停用。
3.如果病变范围较局限，也可考虑内镜下粘膜切除手术进行治疗。 萎缩性胃炎伴肠化生患者应当及时就医，通过详细检查后由医生来制定具体的治疗方案。