肛门口疼的原因有：可能是肛窦炎导致的，可以应用复方角菜酸酯栓、化痔栓、龙珠软膏进行治疗。还可能是急性血栓性外痔导致的，可以应用高锰酸钾洗液、清火栀麦片、马应龙痔疮膏进行治疗。
也可能是肛裂导致的，可以应用高锰酸钾、硝酸银、硝酸甘油膏进行治疗。建议患者去医院查明病因，对症治疗。应遵医嘱使用药物，对以上药物过敏者禁用。