疱疹性咽峡炎主要是由于科萨奇病毒感染引起的，对于疱疹性咽峡炎，需要使用抗病毒的药物进行治疗如板蓝根或者是蒲地蓝口服液或蓝芩口服液，如果发烧比较严重的，可以使用退烧药物布洛芬混悬液进行退热处理，也可以局部使用抗病毒的喷剂进行治疗。
平时应该注意保持口腔卫生，经常用温水漱口，还应该注意吃流质食物，控制好食物温度，避免食物过烫。穿过的衣服，使用的餐具，应该注意及时的进行消毒，可以用热水浸泡，煮沸等方法进行消毒。
建议在医生指导下选择适合自己的方案治疗。