生殖器长水泡可能是生殖器疱疹。如果是带状疱疹引起的，需要积极应用抗病毒的药物对症处理，如奥司他韦、扎那米韦等。还可能是机体生殖器官受到细菌或真菌感染引起的，可以使用抗感染的药物治疗，如咪康唑、酮康唑等。
患者需要结合血常规、体温、肝肾功能、呼吸道病毒、心电图、心肌酶等相关项目综合分析后明确病因。恢复期间要穿宽松的内裤，多吃富含维生素的食物，避免情绪激动。
上述药物治疗均需在专科医生指导下使用药物，对药物过敏者禁用，孕妇及哺乳期妇女应慎用。建议患者根据自身的病情和身体状态，听从专业医生的意见进行规范的诊治。