拔牙三个月了牙窝经常疼可能是由于以下原因导致：
1.创口愈合不良：在拔牙以后如果吸烟喝酒或者是吃了温度过冷过热的食物，会导致局部创口愈合不良，这时候需要对局部进行清创，然后注意保持口腔卫生。
2.干槽症：拔牙过程中创伤比较大或者是出现有感染，局部运行差就容易会诱发干槽症。主要可以通过过氧化氢以及生理盐水冲洗牙窝，并且在牙槽窝内填入碘仿砂条等促进创面的愈合。
3.发炎：拔牙以后如果没有注意好口腔的清洁和卫生，有可能会导致细菌感染，牙窝发炎的症状较为轻微，可以服用消炎止痛的药物缓解，比如双氯芬酸钠缓释片等。必要时需切开脓块进行清洗以及消毒。 建议患者及时到医院复诊，由医生检查后确定病因，并进行治疗，切不可自行盲目用药，以免耽误病情。