牙釉质发育不全、牙齿磨损、牙本质发育不全等原因都会导致牙齿短小，具体分析如下：
1、牙釉质发育不全：牙釉质是人体中最硬的矿化组织，在釉质基质分泌、形成和矿化的整个过程中，如果因营养不良，高热等因素导致成釉细胞代谢异常、基质蛋白和蛋白酶的表达异常都会造成釉质形成的障碍，导致釉质表面缺陷或异常，表现为牙齿短小或牙面色素沉着等。
2、牙齿磨损：牙齿在咀嚼和非咀嚼运动的过程中，因为牙面与牙面间或者牙面与食物间摩擦造成牙齿硬组织的缺损使牙齿变短小。
3、牙本质发育不全：牙齿短小受遗传因素的影响，属于先天性的牙齿发育不完善。遗传对牙齿数目、长短、形态大小影响很大。如果家族中有牙齿短小的人，则后代中出现牙齿短小的概率就会增加。