慢性咽炎的治疗方法一般是先找出病因，针对病因治疗，加强锻炼，增强免疫力，根据病情选择适当的治疗方案，必要时全身给药。
1.病因治疗：要找到主要病因，如糖尿病、肝脏疾病或贫血等全身性疾病，鼻窦炎或反复发作的扁桃体炎等局部疾病。这些疾病都容易引起慢性咽喉炎，因此要针对原发病进行治疗。病情控制住之后，慢性咽喉炎的症状也会减轻。
2.药物治疗：如果是单纯性慢性咽喉炎，可以使用黏液溶解性的祛痰药物进行治疗，必要时可结合中成药治疗。若是干燥萎缩性咽喉炎，应当补充维生素制剂，过敏性咽喉炎需口服抗组胺类药物。若为反流性咽喉炎，和胃食管反流有关，需使用抑制胃酸分泌的药物。建议慢性咽喉炎患者，尽早就医诊治。