胃肠间质瘤靶向药物是比较贵的。胃肠间质瘤靶向治疗是胃肠间质瘤治疗的重要方法，多数患者进入肿瘤晚期后需要长期服用靶向药物。
而且，目前靶向治疗已经进入一线治疗，与手术结合作为术后辅助治疗的手段，这样的一个趋势。胃肠间质瘤靶向药物有舒尼替尼、瑞格替尼，伊马替尼等等。
靶向药物是指直接针对肿瘤细胞进行破坏，杀死癌症细胞，可以避免对全身器官的损害，常代替免疫性药物进行治疗。对于错过了手术时期的胃间质瘤，可以通过靶向药物治疗，但费用相对较高。