新生儿大便水样可能是着凉受寒引起的，注意腹部保暖，注意饮食，避免受凉。可口服补液盐，防止新生儿出现脱水或者电解质紊乱，也可以口服蒙脱石散，能够保护胃肠道的黏膜。
也可能是消化不良引起的，可以口服醒脾开胃颗粒或者乳酸菌素颗粒。食用易消化的食物，避免口服油腻刺激的食物。还可能是肠胃炎引起的，可以先暂时禁食3-4个小时。
在禁食期间不禁水，可以少量地喂口服补液盐水或者温水喝。可服用益生菌和蒙脱石散，保护胃肠道黏膜。建议进一步去医院做详细检查，明确具体病因后在医生指导下对症治疗。