直肠出血可通过手术、药物等方法进行治疗。手术治疗修补或切除病灶处肠管，及时止血，避免直肠出血情况进一步发展等效果。
直肠肿瘤、直肠息肉等直肠出血症状，常用手术名称为腹腔镜下直肠癌根治术、内镜下直肠息肉切除等。药物治疗进行紧急补液，适用于直肠出血较大的患者，目的是纠正脱水、电解质紊乱和酸碱失衡。
常用药物有含钠液、氯化钾、碳酸氢钠等。如果是慢性肠炎类疾病导致的直肠出血，常可以采用药物治疗，如抗生素类药物，头孢西丁等。
出现直肠出血时，应积极配合医生的治疗，以免贻误病情。