不能单纯的从P40阴性或阳性来判断是好还是坏。P40是肺癌中运用免疫组化，鉴别肺癌的性质，如肺腺癌还是肺鳞癌，对临床医生制定治疗方案具有指导意义。
P63蛋白亚型之一。在肺癌中，P40敏感性与P63相当,但特异性优于P63,在肺腺癌中几乎不表达。在病理学中主要用于鉴别肺腺癌和肺鳞癌鉴别，P40在肺腺癌中是阴性，在肺鳞癌中是阳性，特异性比P63更高。
根据患者的不同病理类型，选择的治疗方案和方法也会有所不同，具体的需要做详细性的检查，根据相关检查在医生的指导下治疗。
P40对诊断肺鳞状细胞癌具有高度的敏感性及特异性，联合检测p40和TTF-1对肺腺癌及鳞状细胞癌的鉴别诊断具有较高的实用价值。