血吸虫的致病性主要有急性血吸虫病、慢性血吸虫病、异位血吸虫病以及晚期血吸虫病。
1、急性血吸虫病。须与败血症、疟疾、伤寒与副伤寒，急性粟粒性肺结核，病毒感染，其他肠道疾病鉴别。主要根据籍贯、职业、流行季节，疫水接触史、高热、肝脏肿大伴压痛、嗜酸性粒细胞增多，大便孵化阳性为鉴别要点。
2、慢性血吸虫病。须与慢性菌痢、阿米巴痢疾、溃疡性结肠炎、肠结核、直肠癌等病鉴别。粪便孵化血吸虫毛蚴阳性可确诊。嗜酸性粒细胞增生有助于本病之诊断。肠镜检查及组织检查可有助于确诊。粪便常规检查、培养、X线钡剂灌肠，诊断性治疗有助于诊断与鉴别诊断。
3、异位血吸虫病。有时可闻及干、湿啰音，但重型患者肺部有广泛病变时，胸部X线检查可见肺部有弥漫云雾状、点片状、粟粒样浸润阴影，边缘模糊，以位于中下肺尤为多。肺部病变经病原学治疗后，3~6个月内可逐渐消失。
4、晚期血吸虫病。幼年慢性反复感染，可导致垂体前叶和性腺功能不全，以及上消化道大出血。可考虑进行相对应的手术治疗。 建议患有血吸虫病的患者及时就医，及时治疗，以免产生不良后果。