疱疹和手足口病的区别在于部位、病因及并发症不同，具体分析如下：
1、部位：手足口病：除了口腔黏膜有疱疹外，手足臀部也会出现疱疹。疱疹：多见于口腔内，手足臀部一般没有疱疹，主要症状为口唇疱疹、水痘、带状疱疹等表面凸起的水疱。
2、病因：手足口病：是由于感染肠道病毒引起的，可以服用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物控制高热。疱疹：是由于感染疱疹病毒引起的，可以服用奥司他韦、阿昔洛韦等抗病毒药物及头孢唑啉钠等抗生素治疗。
3、并发症不同：手足口病：部分患儿可引起肺水肿、心肌炎、无菌性脑膜脑炎等并发症。疱疹：可能合并细菌感染，但不会出现脑炎等并发症。建议出现手足口病或疱疹的患者，要及时到医院检查，积极配合治疗，以上药物要遵医嘱使用。