肛周脓肿如果是合并肛瘘的形成，只能通过手术治疗，手术包括完整切除肛瘘瘘管加挂线术，以及新发肛周脓肿切排引流。没有肛瘘的患者，可先采取加强抗感染，金黄散膏外敷新发脓肿，部分患者可完全吸收。
若患者脓肿不能完全吸收并伴有发热症状，需要再次手术引流处理。建议去医院及时检查，在专科医生指导下进行治疗，以免耽误病情，错过最佳治疗时机。