儿童腮腺炎的治疗药物根据引起的病因不同，用药不同。
1.化脓性腮腺炎：是细菌感染导致的腮腺炎，需要积给予敏感抗菌素进行治疗，通常可以选择青霉素类或头孢类抗菌素，引起腮腺炎比较常见的是革兰氏阳性球菌，可以应用阿莫西林、头孢克洛等药物治疗。
2.流行性腮腺炎：是由于病毒感染导致的腮腺炎，通常是自限性过程，不需要使用特殊抗病毒治疗。如果孩子出现发烧，尤其是高烧，体温＞38.5℃时，可以应用退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬，有较好的退烧效果。 孩子有腮腺炎要躺在床上休息，吃流质食物，注意不要吃酸性饮料，保持口腔卫生，饭后必须用生理盐水刷牙。