小儿疱疹性咽炎可以吃一些抗生素药或是中成药进行治疗。西药中可以使用一些抗菌消炎的药物进行治疗，如口服强的松、头孢氨苄颗粒、阿莫西林颗粒等都具有较好的治疗效果，在使用这类西药时一定要在医生的嘱咐下用药。
而中药中都是一些清热解毒的中成药，如银黄颗粒或双黄连口服液等等，效果都是非常好的。如果孩子发烧可以利用物理降温，用温水擦拭手心脚心和额头，应该及时给孩子多喝水，补充体内的缺乏的水分，促进新陈代谢造成的不良产生排出体内，多注意休息。
建议患者及时就医，在医生的指导下规范用药。