儿童频繁眨眼是否可以自愈取决于具体情况。如果单纯是用眼不当引起的，一般通过合理休息眼睛，减少看电子产品的时间可以慢慢自愈。
如果是患有干眼症、比较严重的视疲劳，会伴有眼睛的痒等不适。可以通过局部热敷，加上滴人工泪液的滴眼液来进行缓解，一般预后良好。
如果是由于季节性的过敏，干眼症，睫毛倒睫等情况而引发的炎症，也是会引起儿童出现频繁的眨眼的情况，季节性过敏是可以自行缓解的，但是会反复发作，睫毛倒睫以及干眼症往往是不会自愈的，需要进行对应的治疗。
建议家长及时带孩子到医院就诊，查明病因后对症治疗。