支原体感染的支气管炎其治疗上首先要予以敏感的抗生素抗感染治疗。当支原体感染呼吸系统时，如呼吸系统的喹诺酮类或左氧氟沙星、四环素、大环内酯、阿奇霉素或罗红霉素等，通常使用有效的抗生素。
不应选择青霉素和头孢菌素，这两种抗生素对支原体感染无效。如果是肺部感染了支原体，一般会形成肺炎症状，可以对症性用一些去痰止咳效果的药物来控制病症，比如用溴己新，能让患者的痰液变的稀薄，同时还能够去除痰液。
建议支原体感染支气管炎患者及时就医，在医生的指导下用药，以免产生副作用，耽误病情。