乳腺原位癌可使用化疗药物和内分泌治疗药物等进行治疗，但通常要先经过手术之后再用药。
1、化疗药物：通常使用蒽环类药物和紫杉类药物，如多柔比星、表柔比星、吡柔比星及括紫杉醇、多西他赛等。
2、内分泌治疗药物：通常是口服药物，三苯氧胺（又名他莫昔芬）、托瑞米芬等抗雌激素药物。以上药物需在医生的指导下进行使用，不可自行使用，以免产生不良反应。