贫血、真菌感染、外伤、缺乏微量元素等原因都可导致大拇指指甲表面凹凸不平，具体分析如下：
1、贫血：患有缺铁性贫血会导致指甲出现异常，如指甲苍白、变薄、变平，甚至出现匙状甲。应积极就医明确病因，对症治疗。
2、真菌感染：甲部真菌感染后，患者的甲板会表现为翘起、凹凸不平等，患者早期一般除了甲部颜色变化外不会有其他不适。如果甲部有增厚、萎缩、脱落等情况时应警惕为真菌感染所导致的。
3、外伤：遭受外力撞击，指甲受到伤害时，新长出来的指甲受到影响而表现为凹凸不平的情况。
4、缺乏微量元素：身体缺乏钙时，骨骼发育迟缓，指甲的生长也会受到影响，表现为指甲表面凹凸不平。建议患者积极到医院明确病因，并针对性治疗。