肛门内神经疼可能是肛裂引起的，可以口服麻仁丸、番泻叶等药物治疗，也可能是肛窦炎引起的，可以服用阿莫西林胶囊、替硝唑等药物治疗。
还可能是痔疮引起的，可以外用马应龙痔疮膏、云南白药痔疮膏、肛泰痔疮膏等药物治疗，需注意对药物过敏者禁用，建议去医院及时检查，在专科医生指导下进行治疗，治疗期间应忌烟、酒及辛辣、生冷、油腻等食物。