儿童嗓子有疱一般是由于感染肠道病毒而引起的疱疹性咽峡炎或者是手足口病，可以给患儿及服用抗病毒药物进行治疗，例如抗病毒口服液、蓝芩口服液等清热解毒的中成药进行治疗。
可以局部用药，使用口腔炎喷雾剂、乙酰氨基酚混悬液降温治疗。饮食上要吃流质、半流质的饮食以免刺激咽喉引起疼痛。建议及时到医院进行相关检查，在专科医生指导下进行治疗。