肛窦炎的治疗，包括保守治疗和手术治疗。
1.保守治疗：通常以药物治疗为主。如果患者有持续、剧烈的疼痛，可用一些镇痛药，如氨酚羟考酮等；还可使用有消肿镇痛功能的外用药物，如痔疮栓等；此外还可选择合适的抗生素进行治疗，常使用红霉素、克拉霉素等大环内酯类抗生素，以及甲硝唑等。可以通过口服、静脉滴注、局部涂抹、保留灌肠等方法进行治疗。
2.手术治疗：若保守治疗效果不佳，肛窦炎已经形成隐形瘘管，要及时进行手术治疗。常用的手术方式包括肛乳头切除术、肛隐窝切开引流术等。需根据实际病情选择手术方式。建议肛窦炎患者，尽早就医诊治，以免耽误病情。