肛萎患者用药主要以局部用药。用消毒剂进行外涂，或者是使用抗生素软膏进行局部的外涂，还可以通过中药进行局部的泡洗，另外就是使用抗生素药物进行对症的治疗。
肛瘘单纯的依靠药物治疗效果往往不理想，肛瘘是属于肛门周围感染化脓性质的疾病，是因为肛周脓肿溃破发展而来，会有肛门皮肤处的外口，外壳口会有反复的流脓和流水，会导致肛门周围的潮湿瘙痒和刺痛。
肛瘘主要就是通过肛门局部的望诊，肛门指检进行诊断，在确诊以后需要及早地通过手术的方法进行治疗。建议患者及时到医院就诊，在医生的指导下进行治疗。