肛瘘患者可以通过药物和手术进行治疗。
1.药物治疗：主要是以局部用药为主，是使用消毒剂进行外涂，或者是使用抗生素软膏进行局部的外涂，还可以通过中药进行局部的泡洗，另外就是使用抗生素药物进行对症的治疗。
2.手术治疗：肛瘘单纯的依靠药物治疗效果往往不理想，需要手术治疗，如果是低位的肛瘘、单纯性的肛瘘，主要通过切除的手术方法。手术切除原发的感染内口、肛瘘的管道部分和外口。如果是高位的肛瘘、复杂性的肛瘘，主要是通过挂线的方法进行治疗。 肛萎主要通过肛门局部的望诊、肛门指检进行初步诊断，必要时可以进行直肠内超声的检查，或者肛周核磁共振的检查诊断，明确以后及早通过手术治疗。建议患者及时就诊，在医生的指导下进行治疗。