复杂性肛瘘术后通常要30天以后可以出院，具体时间和患者自身的恢复有关。复杂性肛瘘一般是指高位复杂性肛瘘，其最主要的临床表现是肛瘘的分支增多，或者是瘘管壁增粗，并且有多个外口。
通过肛门局部彩超检查或者是盆腔核磁检查，可看到瘘管分支深度较深，跨越了部分括约肌，手术难度偏大。如果分枝多或者是肛瘘的外口较多时，手术之后的局部伤口也会随之增多，所以复杂性肛瘘的患者手术之后的住院时间较长。
手术之后还需要对局部伤口做好每天的清洁和换药，避免伤口出现假性愈合或者是二次感染，同时还需要在术后半年以内做好定期复查。
建议去正规医院就诊，在医生的指导下进行治疗。