肛门肿痛通常是细菌感染造成的，需要吃抗生素药物。另外，肛门的局部还需要外涂消毒剂，并且使用抗生素软膏进行外涂。患者在饮食上也要适当地进行调整，避免辛辣刺激性、过于油腻的食物。
肛门肿痛如果是因为痔疮导致，一般需要吃促进痔区静脉血液和淋巴回流的药物。还可以同时配合使用痔疮膏、痔疮栓肛管直肠内给药。
如果肛门肿痛是因为肛门周围脓肿导致，主要的治疗方法是通过手术进行治疗。在手术之后按时进行换药，保持手术创面引流的通畅，保持肉芽组织的新鲜。
建议患者及时到医院就诊，在医生的指导下进行治疗。