肠道菌群失调可以使用一些肠道菌、乳酸菌片、金双歧、四联活菌片等。给调节肠道菌群平衡，增强肠道自调节能力有很大帮助。
一般出现肠道菌群失调会导致腹泻、腹痛、呕吐、恶心、发热等症状，是需要用药物进行调解的。如果是消化不良引起的肠道菌群失调可以服用多潘立酮、健胃消食片等药物。
以上药物还是需要在医院医生指导建议下使用，具体用药情况根据患者疾病程度处理。