鱼腥草泡水主要起到清热解毒、消肿排脓、利尿通便的作用，可以治疗像肺热的咳嗽和咳吐黄稠脓痰，甚至是咳吐脓血，咽喉的肿痛胸痛，和湿热下注所导致的尿频、尿急、尿疼，尿系统感染性的疾病。
鱼腥草用于治疗急慢性的支气管炎，肺炎外用皮肤科化脓性的疾病有很好的疗效，比如像蜂窝组织炎丹毒。鱼腥草用于治疗急性的胃炎、盆腔炎，肛周的脓肿，睾丸炎等效果也不错。
在使用鱼腥草时不能食用折耳根，过敏体质的人最好不吃，避免吃了之后出现日光性皮炎。虚寒体质以及没有明显的红肿热痛的阴寒疔疮肿疡者也不要吃。