萎缩性胃炎的癌变信号，主要是活检可以见到肠化以及不典型增生。萎缩性胃炎的癌变率约为1%，胃黏膜光滑的轻度萎缩性胃炎，癌变的几率少。
如果萎缩性胃炎伴有息肉且发现有肠腺的化生和不典型增生者，应该加强随访。肠腺化生与胃癌有一定关系，尤其是胃酸高分泌的腺癌，发生在肠腺化生的基础上，肠腺发生的部位与胃癌发生部位相似，与胃癌的关系比较密切，尤其是结肠型化生。
出现萎缩性胃炎应定期随访，判断肠化生程度及类型和进展情况。不典型增生也就是内瘤变，也是胃癌的癌前疾病。如果是中度以上的要考虑胃早癌，需要进行黏膜剥离术。
如果是轻度的，可以定期随访，观察演变情况。